结石会阻塞尿路并危害尿路黏膜，导致肾功能降低。当并发感染时，肾盂肾炎或肾积脓可能会迅速损害肾脏功能。尿毒症是指肾功能衰竭导致体内肌酐蓄积进而对多器官系统造成危害的一种症候群，只在双侧肾功能严重受损至总功能的33％以下时才会出现，而一旦发生则非常严重。结石堵塞输尿管后，肾功能会受损，如果对侧也有结石发病，则结果会更加严重。对于先天性独肾，对侧肾脏有潜在疾患，如结核、肿瘤、囊肿、海绵肾等，尿毒症的发生就可以预见。因此，尿毒症和结石息息相关。