慢性萎缩性胃炎治疗期间应注意以下问题：

1、感冒时不要随意用药，尤其是解热镇痛类感冒药，会对肝脏和胃肠造成损害。在使用抗生素期间，更应避免与这些药物同时使用，以免相互作用加重肝脏功能的损害和胃肠道的不适症状。如需治疗感冒，建议选择中药成分的感冒冲剂。

2、饮食要忌口，尽量清淡。要避免重口味、熏制、腌制的食物，因为这些食物容易使萎缩性胃炎癌变。在吃抗生素期间，要避免饮酒、吸烟和吃海鲜，这些会增加药物过敏的风险。幽门螺杆菌可能会通过唾液传染，建议分餐，避免相互传染。

3、定期检查才能放心。建议按疗程停用抗生素至少一个月后复查呼气试验，并每年去正规医院做一次连续复查两三年。如果几次检查结果都是阴性，那么就可以说明幽门螺杆菌彻底根除了。如果患者家族成员中有人感染过幽门螺杆菌，或者有较严重的胃病，可以增加复查频率和次数。另外，需要定期复查胃镜，具体时间要根据患者身体状况来定，如明显感觉胃不舒服，要及时复诊、咨询医生。