治疗尖锐湿疣的患者们通常都会关注一个问题：在治疗后，什么时候才能够完全摆脱体内的病毒？实际上， HPV 病毒只会侵袭皮肤或粘膜表层，而不会进入血液。因此，治疗的重点通常是局部治疗，因为通过目前的治疗手段，可以完全清除局部的疣体。一般来说，如果没有复发，治疗后 3 个月，大部分局部病毒可以被清除。在接下来的两年内，90%的患者体内的免疫系统会逐步清除残余的 HPV。虽然存在一些免疫系统低下的患者（如由于肿瘤、移植、自身免疫系统疾病等长期服用免疫抑制剂的患者，以及合并糖尿病或艾滋病的患者）可能需要长期反复斗争，但通常情况下，免疫系统最终会消灭病毒。值得注意的是，长期复发的情况比较罕见。