自闭症的原因：

新陈代谢疾病：如苯酮尿症等先天的新陈代谢障碍，会影响脑神经讯息传递的功能，从而导致自闭症。

遗传的因素：自闭症男童中约10%有染色体脆弱症，而自闭症女性中约20%有智能不足。此外，也有一些家族研究发现有遗传的倾向。

怀孕期间的病毒感染：妇女怀孕期间可能因麻疹或流行性感冒病毒感染，使胎儿的脑部发育受损伤而导致自闭症。

脑伤：包括在怀孕期间窘迫性流产等因素而造成大脑发育不全，生产过程中早产、难产、新生儿脑伤，以及婴儿其因感染脑炎、脑膜炎等疾病造成脑部伤害等因素，都可能增加自闭症机会。

其他因素还包括新陈代谢疾病、遗传因素、脑伤等。