行为治疗：无论在家或在学校，对孤独症儿童最重要的治疗是进行有效的行为训练。在选择训练的目标行为时，要考虑孤独症的严重程度和患儿的功能水平。常用的是行为矫正中的一些方法，如用特定的强化鼓励所期望产生的行为，取消强化以减少不期望的行为；较少使用的方法是轻度的惩罚如暂时隔离法或口头的指责等。行为矫正应及早用于患儿，而且要对患儿父母和老师进行特别训练，让他们学会应用，旨在改善患儿社会交往和语言功能，减少适应不良行为。

教育治疗：儿科医生应当使教师更好地理解孤独症儿童的临床表现，使学校对患儿提供适当的教学措施。在教学上，治疗的主要目标应强调社会技能的发展和语言的交流。而学习目标则根据患儿的功能水平决定之。 在教学中，一个仔细的、有结构的环境对孤独症儿童来说十分重要。当患儿知道生活常规或作息时间安排后，他们会做得很好的。在教学中要帮助患儿逐渐学会适应变化。由于孤独症儿童视觉功能优于语言功能，所以我们要给患儿更多的视觉信息。在促进患儿学习时，将所教的内容分成简单的、清楚的步骤。

药物治疗：
1. 氟哌啶醇：此药能改善活动过度、攻击性行为、改少刻板行为和自伤行为。合适剂量为每天0.5～4.0mg，分2次服。其不良反应为迟发性运动障碍（不自主运动）目前主张在其他干预无效时应用此药，用药时间不宜过长，且剂量偏小。


2. 中枢神经兴奋剂（哌甲酯，即利他林）：减少多动和注意缺陷。用药剂量0.3～0.5mg/（kg•d）。现认为大多数孤独症儿童用此药无明显效果，有的甚至使症状加重，例如患儿更为激惹，刻板行为增加。


3. 三环类抗抑郁药：较为常用的是丙米嗪。对孤独症伴有抑郁症者可见效。如患儿伴有遗尿，可在睡前服12.5～25mg。近年来，5-羟色胺阻滞药氟西汀用于减少孤独者患儿的强迫症状或仪式动作。


4. 利培酮：应用此药可改善活动过度、攻击行为和刻板动作，且不良反应较其他抗精神病药物为轻，较安全。此药从小剂量0.25mg/d开始，每2周增加0.25mg/d，直至1.5mg，不良反应为体重增加、便秘等。


5. 抗癫痫药：25%孤独症儿童有癫痫，可发生在儿童早期，也可出现在青春期。一般用卡马西平或丙戊酸镁或丙戊酸钠作为首选，而苯巴比妥常引起行为问题，故不用。卡马西平的剂量为每天10～20mg/kg，丙戊酸钠或丙戊酸镁为每天20～50mg/kg。

家庭支持和教育：在对患儿评价和诊断之后，应当给予家庭支持。儿科医生能够帮助家庭更现实地认识这一障碍的性质，澄清对此病的错误想法，提供治疗或干预的资源或设施，并组织孤独症父母小组，使这些患儿的父母能够相互交流，探讨家庭对患儿支持的策略和方法。 孤独症儿童的父母常有焦虑、内疚和绝望，而且对患儿的态度或期望上有不切实际的行为表现，这对治疗带来严重的妨碍。所以，要给予父母支持性的咨询，消除他们不良的情绪，客观地认识问题，积极地参与患儿的治疗和教育，持之以恒。