脑脊液因其直接接触中枢神经系统的细胞外间隙,因此对于诊断脑部疾病具有较好的提示。脑脊液常规计数和细胞学的结果多数是非特异性的,如病毒性脑膜炎脑脊液呈淋巴细胞炎症,化脓性脑膜炎呈中性粒细胞炎症,脑囊虫引起脑脊液嗜酸性粒细胞增多,对临床有重要的提示意义。
  另外该法也可作为癫痫的辅助诊断方法，为全面了解患者的脑内情况提供。 脑脊液细胞学对于中枢神经系统各疾病的临床符合率普遍要高于常规计数,可为临床提供更多的信息,有望提高癫痫的诊断准确率。