抗核抗体（ANA）是SLE最常见的自身抗体，阳性率高达95-100％，但特异性不高，可作为SLE的筛查抗体。ANA阴性SLE是一种SLE的亚型，约占全部SLE患者的2％，其发病原因可能包括无ANA产生、自身抗体被受累组织所结合、循环免疫复合物隐藏、应用肾上腺皮质激素及免疫抑制剂、病情进入肾病终末期等。ANA阴性SLE患者的发热、体重减轻、关节痛、肌痛、雷诺现象、口腔溃疡、脱发等非特异性损害与ANA阳性SLE患者相比无明显差异，但手足红斑的发生率明显高于ANA阳性SLE患者，皮肤损害是ANA阴性SLE的显著特征。ANA阴性SLE患者血清中抗Ro/SSA抗体发生率较高，而抗Ro/SSA抗体与光敏感密切相关。ANA阴性SLE患者血清中的抗dsDNA抗体和抗Sm抗体阳性率较低，可能与肾损害和血液系统损害较低有关。总体来说，ANA阴性SLE患者系统损害较少，预后较好。在临床上，疑似SLE患者，ANA检测阴性时，应注意检查其他靶抗原特异性自身抗体，如抗SSA/Ro抗体、抗SSB/La抗体、抗核糖体P蛋白（rRNP）抗体、抗核小体抗体、抗dsDNA抗体等，还应注意检测其他SLE相关自身抗体，如狼疮抗凝物、抗心磷脂抗体、抗β2GPI抗体、抗C1q抗体等。